Сравнение различных вариантов выявления ДНК вирусов TTV, TTMDV и TTMV

Цель исследования. Сравнить различные варианты выявления ДНК TTV, TTMDV и TTMV в плазме крови пациентов с различными заболеваниями печени и у лиц без признаков заболеваний печени.

Материалы и методы. Для выявления ДНК TTV, TTMDV и TTMV использовался метод ПЦР.

Результаты. Обнаружена достаточно высокая частота выявления ДНК вирусов TTV при использовании разных лабораторных подходов. Частота выявления ДНК TTV значимо выше при использовании праймеров для некодирующего региона UTR — 77,3 % при сравнении с кодирующим ORF1 — 38,4 % (р < 0,001) и коммерческим набором реагентов — 53 % (р < 0,005).

Заключение. У пациентов с заболеваниями печени по сравнению со здоровыми лицами значимо чаще выявляются ДНК TTV (90,3 и 65,6 % по UTR-региону и с использованием коммерческого набора соответственно), ДНК TTMV (83,9 % — UTR-регион) и микст ДНК вирусов TTV + TTMDV +TTMV (62,4 % — UTR-регион). С целью стандартизации определения ДНК вирусов семейства TTV методом ПЦР целесообразно создание панели сывороток, содержащей достоверно положительные и отрицательные образцы.

1. Kowarsky M, Camunas-Soler J, Kertesz M, De Vlaminck I, Koh W, Pan W, et al. Numerous uncharacterized and highly divergent microbes which colonize humans are revealed by circulating cell-free DNA. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2017;114(36):9623-9628. https://doi.org/10.1073/pnas.1707009114

2. Nishizawa T, Okamoto H, Konishi K, Yoshizawa H, Miyakawa Y, Mayumi M. A novel DNA virus (TTV) associated with elevated transaminase levels in posttransfusion hepatitis of unknown etiology. Biochem Biophys Res Commun. 1997;241(1):92-97. https://doi.org/10.1006/bbrc.1997.7765

3. Okamoto H. History of discoveries and pathogenicity of TT viruses. Curr Top Microbiol Immunol. 2009;331:1-20. https://doi.org/10.1007/978-3-540-70972-5_1

4. Miyata H, Tsunoda H, Kazi A, Yamada A, Khan MA, Murakami J, Kamahora T, Shiraki K, Hino S. Identification of a novel GC-rich 113-nucleotide region to complete the circular, single-stranded DNA genome of TT virus, the first human circovirus. J Virol. 1999;73(5):3582-3586. https://doi.org/10.1128/JVI.73.5.3582-3586.1999

5. Virus Taxonomy: 2020 Release [Electronic resource]. International Committee on Taxonomy of Viruses [data of access 23 January 2022]. Available from: https://https://talk.ictvonline.org/taxonomy/

6. Reshetnyak V, Maev I, Burmistrov A, Chekmazov I, Karlovich T. Torque teno virus in liver diseases: On the way towards unity of view. World J Gastroenterol. 2020;26(15):1691-1707. https://doi.org/10.3748/wjg.v26.i15.1691

7. Spandole S, Cimponeriu D, Berca L, Mihăescu G. Human anelloviruses: an update of molecular, epidemiological and clinical aspects. Arch Virol. 2015;160:893-908.

8. Maggi F, Bendinelli M. Immunobiology of the Torque teno viruses and other anelloviruses. Curr Top Microbiol Immunol. 2009;331:65-90. https://doi.org/10.1007/978-3-540-70972-5_5

9. Schmidt L, Jensen B, Walker A, et al. Torque Teno Virus plasma level as novel biomarker of retained immunocompetence in HIV-infected patients. Infection 2021;49:501-509. https://doi.org/10.1007/s15010-020-01573-7

10. Chen T, Väisänen E, Mattila P, Hedman K, Söderlund-Venermo M. Antigenic diversity and seroprevalences of torque teno viruses in children and adults by ORF2-based immunoassays. J Gen Virol. 2013;94:409-417. https://doi.org/10.1099/vir.0.046862-0

11. Mankotia D, Irshad M. Development of an Immunoassay for Detection of Torque Teno Virus (TTV) Antibodies Using the N22 Expression Product from TTV Genotype 2. Intervirology. 2017;60(5):207-216. https://doi.org/10.1159/000487481

12. Осипкина ОВ, Воропаев ЕВ, Мицура ВМ, Терешков ДВ, Зятьков АА, Баранов ОЮ. Метод молекулярной диагностики ТТ-вирусной инфекции: инструкция по применению. Гомель; 2018. 15 с.

13. Ninomiya M, Takahashi M, Nishizawa T, Shimosegawa T, Okamoto H. Development of PCR Assays with Nested Primers Specific for Differential Detection of Three Human Anelloviruses and Early Acquisition of Dual or Tri- ple Infection during Infancy. Journal of Clinical Microbiology. 2008;2(46):507-514. https://doi.org/10.1128/JCM.01703-07

14. Hu Y, Al-Moslih M, Al Ali M, Khameneh S, Perkins H, Diaz-Mitoma F, et al. Molecular detection method for all known genotypes of TT virus (TTV) and TTV-like viruses in thalassemia patients and healthy individuals. Journal of clinical microbiology. 2005;43(8):3747-3754. https://doi.org/10.1128/JCM.43.8.3747-3754.2005