<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">zdor</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Проблемы здоровья и экологии</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Health and Ecology Issues</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2220-0967</issn><issn pub-type="epub">2708-6011</issn><publisher><publisher-name>Gomel State Medical University</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.51523/2708-6011.2025-22-1-18</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">zdor-2834</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>НОВЫЕ ТЕХНОЛОГИИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>NEW TECHNOLOGIES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Микробиом-ассоциированные биомаркеры пневмонии у недоношенных новорожденных детей</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Microbiome-associated biomarkers of pneumonia in premature newborns</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0002-5265-0243</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Старовойтова</surname><given-names>А. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Starovoitova</surname><given-names>A. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Старовойтова Анастасия Сергеевна - врач-неонатолог отделения для новорожденных, ГУ «Республиканский научно-практический центр “Мать и дитя”»; соискатель кафедры инфекционных болезней, УО «Гомельский государственный медицинский университет».</p><p>Минск, Гомель</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Anastasia S. Starovoitova - Neonatologist at the Department for Newborns, Republican Scientific and Practical Center “Mother and Child”, Minsk, Belarus; Applicant at the Department of Infectious Diseases.</p><p>Gomel</p></bio><email xlink:type="simple">truhananastas@yandex.by</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0483-7329</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Стома</surname><given-names>И. О.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Stoma</surname><given-names>I. O.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Стома Игорь Олегович - д.м.н., профессор, ректор.</p><p>Гомель</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Igor O. Stoma - Doctor of Medical Sciences, Professor, Rector.</p><p>Gomel</p></bio><email xlink:type="simple">gsmu@gsmu.by</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0001-5751-4294</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Улезко</surname><given-names>Е. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ulezko</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Улезко Елена Альбертовна - д.м.н., профессор, заместитель директора по педиатрии.</p><p>Минск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Alena A. Ulezko - Doctor of Medical Sciences, Professor, Deputy Director for Pediatrics.</p><p>Minsk</p></bio><email xlink:type="simple">ulezko@tut.by</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9435-6109</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Воропаев</surname><given-names>Е. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Voropaev</surname><given-names>E. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Воропаев Евгений Викторович - к.м.н., доцент, проректор по научной работе.</p><p>Гомель</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Evgenii V. Voropaev - Candidate of Medical Sciences, Associate Professor, Vice-Rector for Scientific Work.</p><p>Gomel</p></bio><email xlink:type="simple">voropaev.evgenii@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1931-4224</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Осипкина</surname><given-names>О. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Osipkina</surname><given-names>O. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Осипкина Ольга Викторовна - заведующий научно-исследовательской лабораторией.</p><p>Гомель</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Olga V. Osipkina - Head of the Research Laboratory.</p><p>Gomel</p></bio><email xlink:type="simple">olga.osipkina@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9542-3791</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Зятьков</surname><given-names>А. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ziatskov</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Зятьков Алексей Александрович - старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории.</p><p>Гомель</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Aliaksei A. Ziatskov - Senior Researcher at the Research Laboratory.</p><p>Gomel</p></bio><email xlink:type="simple">ziatskovaa@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6725-5353</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шафорост</surname><given-names>А. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shaforost</surname><given-names>A. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Шафорост Александр Сергеевич - старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории.</p><p>Гомель</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Alexander S. Shaforost - Senior Researcher at the Research Laboratory.</p><p>Gomel</p></bio><email xlink:type="simple">asofocl@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9148-487X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ковалев</surname><given-names>А. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kovalev</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Ковалев Алексей Алексеевич - старший преподаватель кафедры медицинской и биологической физики.</p><p>Гомель</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Alexey A. Kovalev - Senior Lecturer at the Department of Medical and Biological Physics.</p><p>Gomel</p></bio><email xlink:type="simple">kovalev.data.analysis.gsmu@yandex.by</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Республиканский научно-практический центр «Мать и дитя»; Гомельский государственный медицинский университет</institution></aff><aff xml:lang="en"><institution>Republican Scientific and Practical Center “Mother and Child”; Gomel State Medical University</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>Гомельский государственный медицинский университет</institution></aff><aff xml:lang="en"><institution>Gomel State Medical University</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru"><institution>Республиканский-научно-практический центр «Мать и дитя»</institution></aff><aff xml:lang="en"><institution>Republican Scientific and Practical Center “Mother and Child”</institution></aff></aff-alternatives><aff xml:lang="ru" id="aff-4"><institution>Гомельский государственный медицинский университет</institution><country>Belarus</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2025</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>29</day><month>03</month><year>2025</year></pub-date><volume>22</volume><issue>1</issue><fpage>145</fpage><lpage>156</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Старовойтова А.С., Стома И.О., Улезко Е.А., Воропаев Е.В., Осипкина О.В., Зятьков А.А., Шафорост А.С., Ковалев А.А., 2025</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Старовойтова А.С., Стома И.О., Улезко Е.А., Воропаев Е.В., Осипкина О.В., Зятьков А.А., Шафорост А.С., Ковалев А.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Starovoitova A.S., Stoma I.O., Ulezko A.A., Voropaev E.V., Osipkina O.V., Ziatskov A.A., Shaforost A.S., Kovalev A.A.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journal.gsmu.by/jour/article/view/2834">https://journal.gsmu.by/jour/article/view/2834</self-uri><abstract><sec><title>Цель исследования</title><p>Цель исследования. Установить состав микробиома и отобрать целевые таксоны биоматериала верхних дыхательных путей с целью применения результатов в модели постановки диагноза «Врожденная пневмония» (МКБ–10, Р23), основанной на микробиом-ассоциированном подходе к оказанию медицинской помощи недоношенным новорожденным детям.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. Группу исследования составили 154 недоношенных новорожденных ребенка. Забор проводился в первые 5–15 минут жизни стерильным зонд-тампоном. Состав микробиоты верхних дыхательных путей у новорожденных детей определялся методом секвенирования нового поколения. Статистическая обработка данных проводилась в среде программирования R (version4.3.1), программа RStudio (2023.09.1+494). Уровень значимости принят равным 0,05.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. По результатам секвенирования роды Brucella (≥ 5,8 %), Achromobacter (≥ 3,1 %), Ralstonia (≥ 0,3 %), Stenotrophomonas (≥ 9,0 %), Klebsiella (≥ 0,02 %), Pseudomonas (≥ 1,5 %) у детей на фоне хронической внутриутробной гипоксии предложено применять в модели постановки диагноза «Врожденная пневмония» (МКБ–10, Р23) в рамках микробиом-ассоциированного подхода оказания медицинской помощи недоношенным новорожденным детям. Молекулярно-генетически выделена комбинация (Pseudomonas + Klebsiella), значимо преобладающая в группе недоношенных новорожденных детей с верифицированным диагнозом «Врожденная пневмония».</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. Разработка микробиом-ассоциированного подхода к оказанию медицинской помощи недоношенным новорожденным детям с врожденной пневмонией позволит сократить временные затраты на диагностический поиск и позволит проводить терапию, отвечающую принципам персонифицированной медицины.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Objective</title><p>Objective. To establish the composition of microbiome and select target taxa of upper respiratory tract biomaterial in order to apply the results in the model of diagnosis of Congenital pneumonia (ICD – 10 P23), based on a microbiome-associated approach to providing medical care to premature newborns.</p></sec><sec><title>Materials and methods</title><p>Materials and methods. The study group consisted of 154 premature newborns. The sampling was carried out in the first 5-15 minutes of life with a sterile probe swab. The composition of the upper respiratory tract microbiota in newborns was determined by the new generation sequencing method. Statistical data processing was carried out in the R programming environment (version4.3.1), the RStudio program (2023.09.1+494). The significance level is assumed to be 0.05.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. According to the sequencing results, the genera Brucella (≥5.8%), Achromobacter (≥3.1%), Ralstonia (≥0.3%), Stenotrophomonas (≥9.0%), Klebsiella (≥0.02%), Pseudomonas (≥1.5%) in children with chronic intrauterine hypoxia were proposed to be used in the model of diagnosis of “Congenital pneumonia” (ICD – 10 P23) as a part of microbiome-associated approach to providing medical care to premature newborns. A combination (Pseudomonas + Klebsiella) has been isolated molecularly and genetically, which is significantly predominant in the group of premature newborns with a verified diagnosis of Congenital pneumonia.</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion. Development of a microbiome-associated approach to providing medical care to premature newborns with congenital pneumonia will reduce the time spent on diagnostic search, and allow conduct therapy that meets the principles of personalized medicine.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>микробиом верхних дыхательных путей</kwd><kwd>микробиота недоношенных новорожденных детей</kwd><kwd>недоношенные младенцы</kwd><kwd>врожденная пневмония</kwd><kwd>прогнозирование врожденной пневмонии</kwd><kwd>искусственный интеллект</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>microbiome of the upper respiratory tract</kwd><kwd>microbiota of premature newborns</kwd><kwd>premature infants</kwd><kwd>congenital pneumonia</kwd><kwd>prediction of congenital pneumonia</kwd><kwd>artificial intelligence</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Представленные в статье данные получены в рамках выполнения финансируемого задания «Разработать и внедрить метод определения вероятности развития пневмонии у недоношенных новорожденных» подпрограммы «Здоровье матери и ребенка» ГНТП «Научно-техническое обеспечение качества и доступности медицинских услуг»</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The data presented in the article were obtained within performing funded task “To develop and implement a method for determining the probability of developing pneumonia in premature newborns” of the subprogram “Maternal and Child Health” of the State Scientific and Technical Program “Scientific and Technical Quality and Accessibility Assurance of Medical Services”</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Зубков В.В., Байбарина Е.Н., Рюмина И.И., Дегтярев Д.Н. Диагностическая значимость признаков пневмонии у новорожденных детей. Акушерство и гинекология. 2012;(7):68-73. [дата обращения 2025 январь 18]. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=18201953</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zubkov VV, Baibarina EN, Ryumina II, Degtyarev DN. DIagnostic Value of the Signs of Neonatal Pneumonia. Journal “Obstetrics and Gynecology”. 2012;(7):68-73. [date of access 2025 January 18]. Available from: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=18201953</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Инакова Б.Б., Нуритдинова Г.Т., Шамсутдинова Д. Способствующие факторы развития внутриутробных инфекций у недоношенных детей. Re-health journal. 2023;18(2):14-17. [дата обращения 2025 январь 18]. Режим доступа: https://cyberleninka.ru/article/n/sposobstvuyuschie-faktory-razvitiya-vnutriutrobnyh-infektsiy-u-nedonoshennyh-detey</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Inakova BB, Nuritdinova GT, Shamsutdinova D. About Some Etiological Factors of Intrauterine Infections Among Newborns. Re-health journal. 2023;18(2):14-17. [date of access 2025 January 18]. Available from: https://cyberleninka.ru/article/n/sposobstvuyuschie-faktory-razvitiya-vnutriutrobnyh-infektsiy-u-nedonoshennyh-detey (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Антонов А.А., Байбарина Е.Н., Балашова Е.Н., Дегтярев Д.Н., Зубков В.В., Иванов Д.О. и др. Врожденная пневмония (клинические рекомендации). Неонатология: новости, мнения, обучение. 2017;(4):133-148. DOI: https://doi.org/10.24411/2308-2402-2017-00049</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Antonov AG, Baybarina EN, Balashova EN, Degtyarev DN, Zubkov VV, Ivanov DO, et al. Congenital pneumonia (clinical practice guidelines). Neonatology: News, Views, Education. 2017;(4):133-148. (In Russ.). DOI: https://doi.org/10.24411/2308-2402-2017-00049</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Савельева Г.М., Сухих Г.Т., Серова В.Н., Радзинский В.Е., ред. Акушерство. Национальное руководство. Москва: ГЭОТАР-Медиа; 2022. 1080 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Savel’eva GM, Sukhikh GT, Serova VN, Radzinskiy VE, editor. Obstetrics. National guide. Moscow; GEOTAR-Media; 2022. 1080 p. (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Стома И.О. Микробиом дыхательных путей. Учебно-методическое пособие. Москва; 2023. 104 с. [дата обращения ٢٠٢٥ январь ١٨]. Режим доступа: https://www.studentlibrary.ru/book/ISBN9785970476925.html</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stoma IO. Microbiome of respiratory tract. Educational and methodological manual. Moscow: GEOTAR-Media; 2023. 104 p. [date of access 2025 January 18]. Available from: https://www.studentlibrary.ru/book/ISBN9785970476925.html (in Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Стома И.О. Микробиом в медицине: руководство для врачей. Москва; 2024. 320 p.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stoma IO. Microbiome in medicine: a guide for doctors. Moscow: GEOTAR-Media, 2024. 320 p. (in Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Старовойтова А.С., Улезко Е.А., Дармоян Н.А., Болбатовская Е.В., Стома И.О. Актуальность изучения микробиома верхних дыхательных путей при развитии врожденной пневмонии у недоношенных новорожденных детей. Медицинские новости. 2024;(8):26-29. [дата обращения 2025 январь 18]. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=72703129</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Starovoitova AS, Ulezko EA, Darmoyan NA, Bolbatovskaya EV, Stoma IO. The Relevance of Studying the Microbiome of the Upper Respiratory Tract in the Development of Congenital Pneumonia in Premature Newborns. Medical News. 2024;(8):26-29. [date of access 2025 January 18]. Available from: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=72703129 (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Старовойтова А.С., Улезко Е.А., Осипкина О.В., Зятьков А.А., Шафорост А.А., Стома И.О. Микробиом-ассоциированный подход диагностики врожденной пневмонии у недоношенных новорожденных детей: особенности состава микробиоты верхних дыхательных путей и уровень фактора, индуцированного гипоксией (hif - ١ – альфа). Медицинские новости. 2024;(11):77-82. [дата обращения ٢٠٢٥ январь ١٨]. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=79083393</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Starovoitova AS, Ulezko EA, Osipkina OV, Ziatskov AA, Shaforost AA, Kovalev AA, Stoma IO. Microbiome - Associated Approach for the Diagnosis of Congenital Pneumonia in Premature Infants: Features oftThe Composition of the Microbiota of the Upper Respiratorytract and the Level of Hypoxia - Induced Factor (Hif-1). Medical News. 2024;(11):77-82. [date of access 2025 January 18]. Available from: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=79083393 (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Старовойтова А.С., Стома И.О., Улезко Е.А., Ковалев А.А. Микробиом-ассоциированное прогнозирование врожденной пневмонии у недоношенных новорожденных детей. Клиническая инфектология и паразитология. 2024;13(4):429-439. DOI: https://doi.org/10.34883/PI.2024.13.4.029</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Starovoitova AS, Stoma IO, Ulezko AA, Kovalev AA. Microbiome-Associated Prognosis of Congenital Pneumonia in Premature Infants. Clinical Infectology and Parasitology. 2024;13(4):429-439. (In Russ.). DOI: https://doi.org/10.34883/PI.2024.13.4.029</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Старовойтова А.С., Улезко Е.А., Стома И.О. Микробиом верхних дыхательных путей у новорожденных – интеграция в клиническую практику. Педиатрия. Восточная Европа. 2022;10(3):379-386. DOI: https://doi.org/10.34883/PI.2022.10.3.008</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Staravoitava AS, Ulezko EA, Stoma IO. The Microbiome of the Upper Respiratory Tract in Newborns – Integration into Clinical Practice. Pediatrics. Eastern Europe. 2022;10(3):379-386. (In Russ.). DOI: https://doi.org/10.34883/PI.2022.10.3.008</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Starovoitova AS, Ulezko EA, Stoma IO, Kovalev AA. Microbiome-associated prognosis of congenital pneumonia in premature infants: ai as a way of integration into clinical practice. Azərbaycan Pediatriya Jurnalı (Azerbaijan Pediatrics journal). 2024;4(2):105-112. [дата обращения 2025 январь 18]. Режим доступа: https://pediatriyajurnali.az/index.php/apj/article/view/20/21</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Starovoitova AS, Ulezko EA, Stoma IO, Kovalev AA. Microbiome-associated prognosis of congenital pneumonia in premature infants: ai as a way of integration into clinical practice. Azərbaycan Pediatriya Jurnalı (Azerbaijan Pediatrics journal). 2024;4(2):105-112. [дата обращения 2025 январь 18]. Режим доступа: https://pediatriyajurnali.az/index.php/apj/article/view/20/21</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">FastQC: A Quality Control Tool for High Throughput Sequence Data [date of access 2025 January 18]. Available from: https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">FastQC: A Quality Control Tool for High Throughput Sequence Data [date of access 2025 January 18]. Available from: https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bolger AM, Lohse M, Usadel B. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-2120. DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu170</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bolger AM, Lohse M, Usadel B. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-2120. DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu170</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wood DE, Lu J, Langmead B. Improved metagenomic analysis with Kraken 2. Genome Biol. 2019 Nov 28;20(1):257. DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-019-1891-0</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wood DE, Lu J, Langmead B. Improved metagenomic analysis with Kraken 2. Genome Biol. 2019 Nov 28;20(1):257. DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-019-1891-0</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wood DE, Salzberg SL. Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments. Genome Biol. 2014;15(3):R46. DOI: https://doi.org/10.1186/gb-2014-15-3-r46</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wood DE, Salzberg SL. Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments. Genome Biol. 2014;15(3):R46. DOI: https://doi.org/10.1186/gb-2014-15-3-r46</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">RStudio Team (2020). RStudio: Integrated Development for R. RStudio, PBC, Boston, MA [date of access 2025 January 28]. Available from: http://www.rstudio.com/</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">RStudio Team (2020). RStudio: Integrated Development for R. RStudio, PBC, Boston, MA [date of access 2025 January 28]. Available from: http://www.rstudio.com/</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">R Core Team (2022). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. [date of access 2025 January 28]. Available from: https://www.R-project.org/</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">R Core Team (2022). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. [date of access 2025 January 28]. Available from: https://www.R-project.org/</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wickham H, Averick M, Bryan J, Chang W, McGowan L, François R, et al. Welcome to the Tidyverse. J Open Source Softw. 2019;43(4):1686. DOI: https://doi.org/10.21105/joss.01686</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wickham H, Averick M, Bryan J, Chang W, McGowan L, François R, et al. Welcome to the Tidyverse. J Open Source Softw. 2019;43(4):1686. DOI: https://doi.org/10.21105/joss.01686</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
