zdorПроблемы здоровья и экологииHealth and Ecology Issues2220-09672708-6011Gomel State Medical University10.51523/2708-6011.2025-22-1-08zdor-2570Research ArticleЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ МЕДИЦИНА И БИОЛОГИЯEXPERIMENTAL MEDICINE AND BIOLOGYРаспространенность минорных кишечных вирусов у пациентов с острым гастроэнтеритом и в сточных водах Минска и Минской областиPrevalence of minor intestinal viruses in patients with acute gastroenteritis and in wastewater of Minsk and Minsk regionhttps://orcid.org/0000-0001-6431-5050ПоклонскаяН. В.PaklonskayaN. V.

Поклонская Наталья Владимировна - к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории инфекций с природным резервуаром.

Минск

Natallia V. Paklonskaya - Candidate of Biological Sciences, Leading Researcher at the Laboratory of Infections with Natural Reservoir.

Minsk

labsanvir@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-4521-6599ШиловаЮ. А.ShilovaYu. A.

Шилова Юлия Александровна - специалист по контролю качества.

Минск

Yuliua A. Shilova - Quality Control Specialist.

Minsk

Jusa-89@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7309-152XАмвросьеваТ. В.AmvrosievaT. V.

Амвросьева Тамара Васильевна - д.м.н., профессор, заведующий лабораторией инфекций с природным резервуаром.

Минск

Tamara V. Amvrosieva - Doctor of Medical Sciences, Professor, Head of the Laboratory of Infections with Natural Reservoir.

Minsk

amvrosieva@gmail.comhttps://orcid.org/0009-0009-2313-3483ГудковаЕ. О.GudkovaE. O.

Гудкова Елена Олеговна - стажер младшего научного сотрудника лаборатории инфекций с природным резервуаром.

Минск

Elena O. Gudkova - Junior Researcher Trainee at the Laboratory of Infections with Natural Reservoir.

Minsk

labsanvir@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-6488-9422КолтуноваЮ. Б.KaltunovaYu. B.

Колтунова Юлия Борисовна - младший научный сотрудник лаборатории инфекций с природным резервуаром.

Минск

Yuliya B. Kaltunova - Junior Researcher at the Laboratory of Infections with Natural Reservoir.

Minsk

labsanvir@gmail.comРеспубликанский центр гигиены, эпидемиологии и общественного здоровьяRepublican Center for Hygiene, Epidemiology and Public HealthООО «Альгимед техно»Algimed Techno LLC2025300320252216571Copyright © Поклонская Н.В., Шилова Ю.А., Амвросьева Т.В., Гудкова Е.О., Колтунова Ю.Б., 20252025Поклонская Н.В., Шилова Ю.А., Амвросьева Т.В., Гудкова Е.О., Колтунова Ю.Б.Paklonskaya N.V., Shilova Y.A., Amvrosieva T.V., Gudkova E.O., Kaltunova Y.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.gsmu.by/jour/article/view/2570Цель исследования

Цель исследования. Оценить частоту выявления редких (минорных) кишечных вирусов у больных острым гастроэнтеритом (ОГЭ) в столичном регионе Республики Беларусь и изучить распространенность их в общей популяции на основе анализа сточных вод с последующим установлением их генотипов.

Материалы и методы

Материалы и методы. Острый гастроэнтерит вирусной этиологии вызывается широким спектром различных вирусов, распространенность отдельных типов которых существенно различается в разных странах. В течение 2022 г. проанализировано 235 проб фекалий и 233 пробы сточных вод столичного региона Республики Беларусь. Выявление ротавирусов (РВ), норовирусов геногрупп 1 и 2 (НоВ 1 и 2), аденовирусов F (АдВ), энтеровирусов (ЭВ), астровирусов (АсВ), саповирусов (СпВ), парэховирусов (ПЭВ), бокавирусов (БоВ) и вирусов аичи (АиВ) проводилось методом мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени. Генотипы БоВ, СпВ, АсВ определялись с помощью типоспецифической ПЦР и секвенирования.

Результаты

Результаты. Установлено, что у пациентов с ОГЭ преобладали РВ (61,3 %), НоВ2 (14,5 %) и АдВ (12,8 %), а минорные вирусы были обнаружены в общей сложности у 6,4 % пациентов. Наиболее часто в сточных водах выявлялись АдВ (33,6 %), БоВ (31,4 %), РВ (11,7 %) и АсВ (6,7 %). Молекулярно-генетическое типирование БоВ, АсВ, СпВ позволило определить циркуляцию следующих их генотипов: БоВ генотипа HBoV-1, HBoV-2, HBoV-3, АсВ генотипа HAsV-1 и СпВ генотипа HuSpV GI.2.

Заключение

Заключение. Полученные результаты свидетельствуют о том, что, несмотря на низкую частоту выявления БоВ и АсВ у пациентов с клиническим диагнозом ОГЭ, они широко циркулируют в популяции и могут быть причиной легких случаев ОГЭ, не попавших в поле зрения инфекционистов и в отношении которых не проводилась лабораторная диагностика.

Objective

Objective. To assess the detection frequency of rare (minor) enteric viruses in patients with acute gastroenteritis in the capital region of the Republic of Belarus, and to study the prevalence of them in general population based on wastewater analysis, with the subsequent establishment of their genotypes.

Materials and methods

Materials and methods. Acute gastroenteritis (AGE) of viral etiology is caused by a wide range of different viruses, the prevalence of individual types of which varies significantly in different countries. 235 fecal samples of acute gastroenteritis (AGE) patients and 233 wastewater samples were analyzed during 2022. Detection of rotaviruses (RV), noroviruses of genogroups 1 and 2 (NoV 1 and 2), adenoviruses F (AdV), enteroviruses (EV), astroviruses (AsV), sapoviruses (SpV), parechoviruses (PEV), bocaviruses (BoV) and aichi viruses (AiV) was performed with “real time” multiplex PCR. Genotypes of BoV, AsV, SpV were determined by use of type-specific PCR and sequencing.

Results

Results. It was found that RV (61.3%), NoV2 (14.5%) and AdV (12.8%) were predominant in patients with AGE, and minor viruses were detected in a total of 6.4% of patients. AdV (33.6%), BoV (31.4%), RV (11.7%) and AsV (6.7%) were most frequently detected in wastewater. Molecular genetic typing of BoV, AsV, SpV made it possible to determine the circulation of the following genotypes: BoV genotypes HBoV-1, HBoV-2, HBoV-3, AsV genotype HAsV-1 and SpV genotype HuSpV GI.2.

Conclusion

Conclusion. The obtained results indicate that, despite the low frequency of detection of BoV and AsV in patients with a clinical diagnosis of AGE, they widely circulate in the population and may be the cause of AGE mild cases that have not seen by infectologists and for which laboratory diagnostics have not been carried out.

кишечный вирусастровируссаповирусбокавируспарэховирусаичи вирусострый гастроэнтеритсточная водаenteric virusastrovirussapovirusbocavirusparechovirusaichi virusacute gastroenteritiswastewaterИсследование проведено в рамках выполнения задания ГНТП без спонсорской поддержкиThe study was carried out as part of the assignment of the State Scientific and Technical Commission without sponsorshipReferencesWhyte L, Al-Araji R, McLoughlin, L. Guidelines for the management of acute gastroenteritis in children in Europe. Arch Dis Child Educ Pract Ed. 2015;100(6):308-312. DOI: https://doi.org/10.1136/archdischild-2014-307253Whyte L, Al-Araji R, McLoughlin, L. Guidelines for the management of acute gastroenteritis in children in Europe. Arch Dis Child Educ Pract Ed. 2015;100(6):308-312. DOI: https://doi.org/10.1136/archdischild-2014-307253Freeman K, Mistry H, Tsertsvadze A, Royle P, McCarthy N, Taylor-Phillips S, et al. Multiplex tests to identify gastrointestinal bacteria, viruses and parasites in people with suspected infectious gastroenteritis: a systematic review and economic analysis. Health Technol Assesst. 2017;21(23):1-188. DOI: https://doi.org/10.3310/hta21230Freeman K, Mistry H, Tsertsvadze A, Royle P, McCarthy N, Taylor-Phillips S, et al. Multiplex tests to identify gastrointestinal bacteria, viruses and parasites in people with suspected infectious gastroenteritis: a systematic review and economic analysis. Health Technol Assesst. 2017;21(23):1-188. DOI: https://doi.org/10.3310/hta21230Oude Munnink B, Van Der Hoek L. Viruses Causing Gastroenteritis: The Known, The New and Those Beyond. Viruses. 2016;8(2):42-45. DOI: https://doi.org/10.3390/v8020042Oude Munnink B, Van Der Hoek L. Viruses Causing Gastroenteritis: The Known, The New and Those Beyond. Viruses. 2016;8(2):42-45. DOI: https://doi.org/10.3390/v8020042Kitajima M, Hata A, Yamashita T, Haramoto E, Minagawa H, Katayama H. Development of a reverse transcription-quantitative PCR system for detection and genotyping of aichi viruses in clinical and environmental samples. Appl Environ Microbiol. 2013;79(13):3952-3958. DOI: https://doi.org/10.1128/AEM.00820-13Kitajima M, Hata A, Yamashita T, Haramoto E, Minagawa H, Katayama H. Development of a reverse transcription-quantitative PCR system for detection and genotyping of aichi viruses in clinical and environmental samples. Appl Environ Microbiol. 2013;79(13):3952-3958. DOI: https://doi.org/10.1128/AEM.00820-13van Maarseveen NM, Wessels E, de Brouwer CS, Vossen AC, Claas EC. Diagnosis of viral gastroenteritis by simultaneous detection of Adenovirus group F, Astrovirus, Rotavirus group A, Norovirus genogroups I and II, and Sapovirus in two internally controlled multiplex real-time PCR assays. J Clin Virol. 2010 Nov;49(3):205-210. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jcv.2010.07.019van Maarseveen NM, Wessels E, de Brouwer CS, Vossen AC, Claas EC. Diagnosis of viral gastroenteritis by simultaneous detection of Adenovirus group F, Astrovirus, Rotavirus group A, Norovirus genogroups I and II, and Sapovirus in two internally controlled multiplex real-time PCR assays. J Clin Virol. 2010 Nov;49(3):205-210. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jcv.2010.07.019Rovida F, Campanini G, Piralla A, Adzasehoun KM, Sarasini A, Baldanti F. Molecular detection of gastrointestinal viral infections in hospitalized patients. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013 Nov;77(3):231-235. DOI: https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2013.07.020Rovida F, Campanini G, Piralla A, Adzasehoun KM, Sarasini A, Baldanti F. Molecular detection of gastrointestinal viral infections in hospitalized patients. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013 Nov;77(3):231-235. DOI: https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2013.07.020Kantola K, Sadeghi M, Antikainen J, Kirveskari J, Delwart E, Hedman K, et al. Real-Time Quantitative PCR Detection of Four Human Bocaviruses. J Clin Microbiol. 2010;48(11):4044-4050. DOI: https://doi.org/10.1128/JCM.00686-10Kantola K, Sadeghi M, Antikainen J, Kirveskari J, Delwart E, Hedman K, et al. Real-Time Quantitative PCR Detection of Four Human Bocaviruses. J Clin Microbiol. 2010;48(11):4044-4050. DOI: https://doi.org/10.1128/JCM.00686-10Yan H, Yagyu F, Okitsu S, Nishio O, Ushijima H. Detection of norovirus (GI, GII), sapovirus and astrovirus in fecal samples using reverse transcription single-round multiplex PCR. Journal of Virological Methods. 2003;114(1):37-44. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2003.08.009Yan H, Yagyu F, Okitsu S, Nishio O, Ushijima H. Detection of norovirus (GI, GII), sapovirus and astrovirus in fecal samples using reverse transcription single-round multiplex PCR. Journal of Virological Methods. 2003;114(1):37-44. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2003.08.009Noel J, Lee T, Kurtz J, Glass R, Monroe S. Typing of human astroviruses from clinical isolates by enzyme immunoassay and nucleotide sequencing. J Clin Microbiol. 1995;33(4):797-801. DOI: https://doi.org/10.1128/jcm.33.4.797-801.1995Noel J, Lee T, Kurtz J, Glass R, Monroe S. Typing of human astroviruses from clinical isolates by enzyme immunoassay and nucleotide sequencing. J Clin Microbiol. 1995;33(4):797-801. DOI: https://doi.org/10.1128/jcm.33.4.797-801.1995Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular 10. Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular Biology and Evolution. 2013;30(12):2725-2729. DOI: https://doi.org/10.1093/molbev/mst197Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular 10. Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular Biology and Evolution. 2013;30(12):2725-2729. DOI: https://doi.org/10.1093/molbev/mst197Altschul S, Gish W, Miller W, Myers E, Lipman D. Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology. 1990;215(3):403-410. DOI: https://doi.org/10.1016/s0022-2836(05)80360-2Altschul S, Gish W, Miller W, Myers E, Lipman D. Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology. 1990;215(3):403-410. DOI: https://doi.org/10.1016/s0022-2836(05)80360-2Информационный бюллетень «Эпидемиологическая ситуация по острым кишечным инфекциям, сальмонеллезам, энтеровирусным инфекциям в Республике Беларусь за 2022 год». Минск; 2023. с. 8-9, 25.Information bulletin “Epidemiological situation of acute intestinal infections, salmonellosis, enterovirus infections in the Republic of Belarus for 2022”. Minsk; 2023. pp. 8-9, 25. (in Russ.).De R, Liu L, Qian Y, Zhu R, Deng J, Wang F, et al. Risk of acute gastroenteritis associated with human bocavirus infection in children: A systematic review and meta-analysis. PloS one. 2017;12(9):e0184833. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0184833De R, Liu L, Qian Y, Zhu R, Deng J, Wang F, et al. Risk of acute gastroenteritis associated with human bocavirus infection in children: A systematic review and meta-analysis. PloS one. 2017;12(9):e0184833. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0184833Шилова Ю., Паклонская Н., Амвросиева Т., Калтунова Ю., Бельская И. Саповирусный и астровирусный острый гастроэнтерит в Республике Беларусь. Евразийский журнал прикладной биотехнологии. 2022;(4):14-22. DOI: https://doi.org/10.11134/btp.4.2022.2Shilova Y, Paklonskaya N, Amvrosieva T, Kaltunova Y, Belskaya I. Sapovirus and astrovirus acute gastroenteritis in the Republic of Belarus. Eurasian Journal of Applied Biotechnology. 2022;(4):14-22. (in Russ.). DOI: https://doi.org/10.11134/btp.4.2022.2

The authors declare that there are no conflicts of interest present.